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Sujets de thèse
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DRF : Sujet de thèse SL-DRF-17-0506

DOMAINE DE RECHERCHE
Bio-informatique, simulation bio-moléculaire / Sciences du vivant
INTITULÉ DU SUJET Français English

Modélisation moléculaire de la formation d’amyloïdes fonctionnelles

RÉSUMÉ DU SUJET

Notre équipe étudie les mécanismes d’assemblage de fibres amyloïdes fonctionnelles formées par des hormones peptidiques. Contrairement aux fibres amyloïdes pathologiques, ces fibres dites "fonctionnelles" sont capables de se désassembler sous l’effet d’un stimulus physico-chimique. In vivo, ces fibres servent à stocker des hormones dans des vésicules denses avant leur utilisation.

Dans le cadre de ce projet, nous cherchons à compléter les études expérimentales (microscopie électronique, spectroscopies et diffusion des rayons X) par des simulations moléculaires afin de mieux comprendre la structure et les mécanismes de formation de ces objets. En effet, les assemblages supramoléculaires passent par la formation d’espèces transitoires difficilement accessibles par les méthodes expérimentales traditionnelles. Nous chercherons à modéliser les conformations prises par les peptides en solution en fonction de leur état de charge, cartographier les chemins d’énergie libre conduisant à la formation d'intermédiaires et déterminer le rôle spécifique des différentes interactions en jeu.

Ces travaux de simulation se feront en interactions constantes avec les études expérimentales menées en parallèle.

http://ibitecs.cea.fr/drf/ibitecs/Pages/services/sb2sm/lbms/modelisation-moleculaire-proteines-membranaires.aspx

FORMATION NIVEAU MASTER RECOMMANDÉ

bioinformatique

INFORMATIONS PRATIQUES
Institut rayonnement et matière de Saclay
Service Nanosciences et Innovation pour les Materiaux, la Biomédecine et l'Energie
Laboratoire Interdisciplinaire sur l'Organisation Nanométrique et Supramoléculaire
Centre : Saclay
Date souhaitée pour le début de la thèse : 01/10/2017
PERSONNE À CONTACTER PAR LE CANDIDAT

Frédéric GOBEAUX  

CEA
DRF/IRAMIS/NIMBE/LIONS
Laboratoire Interdisciplinaire sur l'Organisation Nanométrique et Supramoléculaire (LIONS)
NIMBE - UMR 3685 CEA/CNRS
CEA Saclay, Bât. 125, pièce 44B
F-91191 Gif-sur-Yvette

Téléphone : +33 1 69 08 24 74

UNIVERSITÉ / ÉCOLE DOCTORALE
Paris-Saclay
Interfaces: Approches interdisciplinaires / fondements; applications et innovation
DIRECTEUR DE THÈSE

Stéphane ABEL

CEA
DRF/IBITEC-S/SB²SM/LBMS
DRF//IBITEC-S/SB2SM
CEA Saclay
Bat 528 - Pce 138B
F-91191 Gif-sur-Yvette