Le conseil d’orientation, présidé par l’administrateur général du CEA ou son représentant, émet des avis sur l’organisation de l'INSTN, le plan d'actions pour l'année à venir et son exécution en cours d'année, le budget et, le cas échéant, ses états rectificatifs, le plan d'emploi, le rapport annuel, avant leur présentation au conseil d'enseignement. Il se réunit une ou deux fois par an.
Le conseil d’orientation est composé des membres suivants :
Les membres du conseil d’orientation sont désignés pour une durée de 4 ans renouvelables, exceptés les membres de droit, le membre du personnel, suivant les élections du Conseil d’unité, et le représentant des étudiants, désigné pour une durée d’un an.